大业十年底，大隋废总管府，在西🀱🀧域设西域都护府📗🚼，黄明辽成为大隋在西域的第一任🗍都护。
都护府的权利比较笼统，但相较于总管府，肯定是更加广大。总管府主要管军，军🐨🎢事目的更为重要。而都护府的职责是“抚慰诸藩，辑宁外寇”，凡对周边民族之“抚慰、征讨、叙功、罚过事宜”，皆其所统，主要目的是理藩。
西州总管府改西域都护府，使得黄明🄢辽可以更加名正言顺地😛🂉🌹管理西域🞽🙪各属国了。
于是黄明辽继续经营伊🐃☱🃊吾、北庭、交河三郡，以为西域都护府的腹心之地。伊吾已经经营十多年；交河🀱🀤之地虽新附，但以👻🎅汉人居多；而北庭更是西域都护府的驻地。三郡有汉民八万户，占据了整个西域汉民的七成。
三郡之中，黄明辽兼任伊吾郡太守，李节兼任北庭郡太守。考🌻虑到三🞽🙪郡下属只有十三个县，虽然面积广大，但实际上只是一个郡的体量。设置三个郡，既不方便管理，又多置机构，还使得都护府下的机🆈🍡构有些臃肿。
而且更重要的是，西域极其缺乏文官。西🌵🃛😠域之地缺乏纯文官生存的土壤，💜很多行政官🗍员都是由军官改任的。黄明辽新置西域五镇，调走了大批文官，使得三郡文官更少，不少人都是一人兼着好几个职务，极不稳妥。
于是黄明辽与李节商议🐃☱🃊，暂时搁置三郡，由都护府直接管理下属各县。同时三郡的官府也皆裁撤，官员分配到各紧要之地。
而且最重要的是，由都护府直辖这十三县，就🆔🏒🙣能保证这八万户汉民始终控制住都护府的手中，不至于生出旁🖁🏦的事情。
李节听了，也觉得有道理。整个西域的汉民、粮食、府库、工坊、马场多集中在这里，都护府牢牢控制住三郡直到，就相当于控制了西♐🚝域🞘诸军的命脉。
于是都护府下令裁撤三郡的郡府🎐🐓，由都护府直接管辖三郡之中的十一个县的民政和军事👣。
被伊吾🌏♪郡代管的且末、鄯善二县，与三郡隔着大沙海和莫贺延碛，从轮台前往二县，必👣须要绕道焉耆或者是敦煌，来往相当不便，于是将二县交给敦煌郡代管。并在蒲昌海（今新疆罗布泊）重设海头县，以为西域南线之屏障。
黄明辽又整合三郡兵马，分设四军，每军约四千五百人，都护府直辖，由尉🚐💞迟恭、暴固、慕容正言、史大奈四人分领，加上三郡下辖的各镇、戍、堡，共领兵三万两千余人。
当然，这也只是定额，缺员有上万之数。
不🜠🃢过四军的设立使🏨得都护府随时可以调集一支成编制的集团军队，可应🟁🚎💐对西域出现的大部分挑战。
三郡暂时废除之后，天🐃☱🃊山以北只剩下了双河郡。黄明辽又🎟💚💜命蒙跃总揽西北面军事，定兵额六千。🅑🅴
此时的西域，经过黄明辽的改制，形成了一个南北并进的双头鹫模式，类似于唐朝北庭、安⛶🞶西二都护府分治的场面。
短时间内，没有中央政府的全力支持，西域都护府没有能力继续西🏐🙓拓。但通过稳定的政治结构和强大的军事实力，也能保证整个天山😡🂸📨南北局势的稳定。
······
冬去👡春来，到🖞📭了大业十一年，黄明辽🄢一直处于紧张之中。
去年冬天的勃达岭之战，西突厥因为各种原因，不得不与大隋签订了不平等的条约，放弃了对天山以南的管辖权。虽然黄明辽也依约送西突厥的使节前往东都求🃪🚢亲，☔但射匮可汗是个自负的人，吃了这么大的亏，如何不从其它地方找回🍛🈰场子。
黄明辽除了命🖞📭黄明诚加紧防御，甚至命达奚葛随时准备进入😛🂉🌹伊列河谷，抄西突厥的后路。
但出乎黄明辽的意料，射匮可汗保持的相当平静。无论是蒙跃在双河一带的开拓，还是秦琼兵进疏勒、高震兵进于阗，射匮可汗都保持♐🚝了相当的克制。虽然西突厥也派遣的小规模的军队阻🛂🙨拦，但并未发生大规模的交战。
刚开始黄明辽还纳闷射匮可汗怎么转性了，变得如此温顺🎟💚💜，后来才从河中传来情报，之前兵败南逃🅪吐火罗的阿史那匐职、阿史🔭那悉密多兄弟又从吐火罗杀了回来。
当初河中之乱为射匮可汗平定，阿史🄢那匐职兄弟二人率残部逃往了吐火罗，又转道前往呼罗珊。在这里，二人得到了萨珊波斯国王库思老二世的支持。